中国上下五千年历史，春秋时百家争鸣，汉朝时百家中分出了胜负，汉武帝罢黜百家独尊儒术。随后中国数千年的王朝都沿用了儒家学派的教义用以教化民众。数千年来的儒家思想固然给中国带来了丰富的文化遗产，可也使中国多次遭到灭顶之灾。
儒家学派讲究忍让和妥协。不到最后关头不会反抗，导致中国多次被外族侵扰,凌辱，践踏。外国占领后民众始终无法拧成一股绳反抗侵略。这点在五胡乱华，靖康之难，崖山之役，满清灭明等多次王朝更替中体现。泱泱中华，汉族人所有数量是这些外族的千倍，万倍，十万倍。但敢于反抗的却少之又少。大多数人都安于现状。这与儒家提倡反对战争以德服人是分不开的。可你打着和平友好，以德服人的旗子去和别人讲道理，没人会理你。战争中一切的道德都得靠边站。在这点上俄国人宁可火烧家园也不留给敌人的精神相比之下更加值得推崇。
除了上述的“仁”以外儒家的教义中还有大量想法是反人权及带有歧视色彩的。儒家着作《论语·阳货》中写到了“唯女子与小人难养也。”三纲五常中“夫为妻纲”把儒家学派歧视妇女的本性暴露无遗。这大大增生了中国百姓心中更多的男权主义色彩。
儒家学说同时又极度蔑视法律的存在。认为法与孝中，孝更为重要。比如说要“子为父隐，父为子隐。”儿子应当在父亲违法后依旧包庇父亲，这一想法完全是无视了法律的存在。儒家思想一味排斥法律规章自以为人们都可以有良好的自我约束能力，这就是白日做梦！就是在这种思想的作祟下，当今的中国大陆有一大批的人以此为借口，为自己的罪行开脱。
儒家在被当时各朝各代推广时大量传播其“万般皆下品，唯有读书高。”的理念并同时告诉人们，他们学习不是为了报销国家而是为了当官，指挥别人“学而优则仕。”。
最后，儒家思想过分注重等级观念，让人们认为必须无条件服从上级的命令不得反抗或提出异议。这个做法过分压抑了个性，把所有人教育的循规蹈矩。
综上所述，儒家思想在中国根深蒂固，造成了巨大的负面作用。